本文不以功能清單判斷版本，而是按研究者、腳本維護者、學生與課題組管理者的實際責任分流。新課題預設採用 SPM 25.01.02，在研論文保留 SPM12，正在遷移的專案則以隔離環境完成雙軌回歸後再決定。
本文不以功能清單判斷版本，而是按研究者、腳本維護者、學生與課題組管理者的實際責任分流。新課題預設採用 SPM 25.01.02，在研論文保留 SPM12，正在遷移的專案則以隔離環境完成雙軌回歸後再決定。
截至 2026 年 9 月 7 日，SPM 官方 GitHub 發行頁將 25.01.02 標為最新穩定發行版；因此，新課題直接選 SPM 25.01.02，在研論文、歷史復現或深度依賴舊腳本的專案則先保留 SPM12，遷移時必須在隔離環境中雙軌回歸，而不是覆蓋原有環境。官方發行頁 可核對這項版本狀態。
症狀：實驗室要在 Apple Silicon Mac 上開始或遷移 SPM，但新舊版本、MATLAB 授權和舊腳本互相牽制。
最快解法：新課題採用 SPM 25.01.02；在研論文保留 SPM12；遷移中的專案建立兩套獨立環境，以代表性資料決定是否切換。
這篇文章適合三類讀者：首次搭建 fMRI、PET、EEG 或 MEG 環境的研究生；正在使用 SPM12 完成論文或復現歷史結果的科研人員；以及負責 Apple Silicon Mac、MATLAB 授權和課題組環境交付的技術支援人員。
版本選擇不應從「哪個版本功能較新」開始，而應先看研究結果是否已經被舊環境綁定。SPM 官方版本號說明可用來核對版本命名與發行狀態；其中尚未成為穩定版的預發布版本，不應直接納入生產科研流程。SPM 官方版本號說明 提供了核對依據。
| 研究狀況 | 預設選擇 | 必須保留的證據 | 停止或回退條件 |
|---|---|---|---|
| 全新課題，沒有歷史環境 | SPM 25.01.02 | 版本輸出、介面啟動、最小批次、結果檔案 | 最小流程無法完成，或核心工具箱未能使用 |
| 已投稿、審稿或準備補充分析 | 先保留 SPM12 | 原始 SPM.mat、腳本、設定、輸入資料 | 新版輸出差異無法由參數或資料解釋 |
| 需要復現舊論文或實驗室既有結果 | SPM12 為基線 | 舊環境資訊與歷史輸出 | 尚未建立可比較的雙軌結果 |
| 維護自訂 MATLAB 腳本或第三方工具箱 | SPM12 + SPM 25.01.02 雙軌 | 函式、批次欄位、MEX、工具箱聲明及錯誤記錄 | 任何無法解釋的錯誤或結果差異 |
| 沒有 MATLAB 授權 | 先評估 Standalone | Runtime、介面、批次方式與擴充需求 | 自訂 MATLAB 程式或額外工具箱無法驗證 |
SPM12 已被官方相容性頁面列為不再支援的舊版本，但「不再支援」不等於既有論文可以立即改版。對已經產生結果的研究而言，版本本身也是方法的一部分。SPM12 官方相容性說明 應與原始研究紀錄一起保存。
首次使用 SPM 的研究者，通常沒有必要為了配合舊教材而主動建立 SPM12 環境。只要課題沒有既定腳本、歷史輸出或指定的第三方工具箱，SPM 25.01.02 更適合作為新流程的初始基線。
這個判斷有三個限制條件。第一，必須先核對官方穩定發行狀態，而不是把預發布版本當成生產版本。第二，必須使用官方建議的安裝路線建立環境。第三，不能把「圖形介面能打開」誤當成整個研究流程已通過。
SPM 官方安裝說明 所描述的安裝方式，應成為新課題的起點。完成後，至少要留下以下驗收資料：
| 驗收項目 | 通過證據 | 不通過時的處理 |
|---|---|---|
| 版本識別 | 命令列或 MATLAB 輸出清楚顯示 SPM 版本 | 截圖不足時，保存完整文字輸出 |
| 圖形介面 | SPM 主介面可啟動，路徑沒有混入舊版本 | 清理 MATLAB 路徑後重新測試 |
| 最小批次 | 使用代表性小資料完成一次最小流程 | 記錄錯誤，不直接換成另一版本 |
| 結果生成 | 預期的結果檔案、記錄檔與目錄結構正常產生 | 檢查寫入權限和輸入資料 |
| 可重建性 | 另一個乾淨工作目錄可重做同一流程 | 若只能依賴個人啟動設定，暫停交付 |
新課題最好在正式收集或處理全量資料前完成這個基線。否則日後發現路徑、授權或工具箱問題時，研究者很難分辨問題來自 SPM、MATLAB、資料本身，還是課題組共用設定。
正在投稿、審稿、撰寫補充分析或復現既有論文的研究者，優先考慮保留 SPM12。原因不是 SPM 25.01.02 一定會產生不同結果，而是升級會同時改變多個可能影響結果的條件：函式實作、預設值、MATLAB 路徑、擴充套件、MEX 載入方式，以及作業系統環境。
SPM12 官方發布說明可作為舊環境的文獻依據，但不能代替課題組自身的環境封存。SPM12 發布說明 建議與以下資料一併保存：
SPM.mat 與批次腳本；提醒：論文正在進入關鍵節點時，版本升級不應與投稿、審稿回覆或主要結果重算同時進行。先複製環境，再在副本測試；原始環境應保持只讀。
若確實需要新版功能或新的 Apple Silicon 部署方式，先以脫敏資料完成小規模比較。比較項目不只包括最終圖片，也要包括關鍵統計值、輸出檔案結構、批次記錄和處理失敗的位置。只要差異尚未能由明確的設定變更解釋，就回到 SPM12。
對維護實驗室模板、MATLAB 腳本或 SPM 擴充的開發型使用者而言，版本遷移不是重新安裝，而是一次相容性審查。即使 SPM 25.01.02 的介面能開啟，也不能據此推論所有舊程式可直接執行。
建議依照以下順序檢查：
一、搜尋腳本中的 SPM 函式呼叫、硬編碼路徑與自訂 callback。
二、逐項比對批次欄位名稱、資料型別與預設參數。
三、檢查第三方工具箱的官方說明是否明確列出新版支援範圍。
四、確認 MEX 檔案是否為目前 Apple Silicon 環境可載入的架構。
五、在相同脫敏輸入資料上執行舊版與新版。
六、保存完整錯誤日誌、輸出檔案和差異摘要。
SPM 官方 MEX 編譯文件說明了原生二進位元件在環境遷移時需要獨立處理；MathWorks 的 MEX 平台相容性文件 也指出，MEX 檔案的平臺架構必須與執行環境相容。因此，遇到 MEX 載入錯誤時，不能只重新加入 MATLAB 路徑。
| 回歸層級 | 測試內容 | 可接受結論 |
|---|---|---|
| 函式層 | 自訂函式、路徑與輸入欄位 | 所有警告均可解釋 |
| 批次層 | 完整批次流程與依賴順序 | 不需手動改動即可完成 |
| 結果層 | 關鍵統計值、影像與輸出結構 | 差異符合預先定義的判準 |
| 交付層 | 乾淨帳戶或新工作目錄重建 | 不依賴個人隱藏設定 |
| 回退層 | SPM12 原流程再次執行 | 舊結果仍可被重現 |
任何無法說明的輸出差異都應觸發回退，而不是以「大致相同」作為通過理由。這也是雙軌方案比直接覆蓋舊環境更適合研究用途的地方。
學生或課題組若沒有 MATLAB 授權，可以評估 SPM 25 的 Standalone 路線，但要先確認任務是否真的適合。SPM 官方提供 Standalone 安裝與使用說明，這條路線可能降低授權門檻，卻不代表所有 MATLAB 程式碼和額外工具箱都能原樣帶入。
評估時應拆開四件事：
若流程只是使用標準介面完成固定分析，Standalone 值得先做小樣本驗證。若流程依賴自訂 MATLAB 程式、特殊工具箱或實驗室多年累積的腳本，則不能只因為不需要購買授權就直接選用。研究者應先完成一組代表性任務，再決定是否將它作為正式環境。
Apple Silicon 的重點不只是遠端畫面是否順暢，而是主機端架構、MEX 載入、MATLAB 路徑和長時間批次是否穩定。SPM 25.01.02 與 SPM12 不應共用混亂的啟動檔案、可寫目錄或未審查的 MATLAB 路徑。
MathWorks 的 Apple Silicon 支援文件 可用來核對 MATLAB 對 Apple Silicon 的支援範圍；SPM 官方 MEX 編譯說明 則應用於處理原生二進位元件，而不是用來推斷所有第三方擴充都已相容。
建議按照以下步驟落地：
一、建立兩個獨立的 SPM 目錄，禁止新版直接覆蓋舊版。
二、為兩個版本分別設定 MATLAB 路徑和啟動檔案。
三、分開指定暫存目錄、輸出目錄與可寫工作目錄。
四、先驗證原生架構、MEX 載入和圖形介面，再測試批次流程。
五、使用同一份脫敏資料執行代表性任務，保存輸出與日誌。
六、測試遠端圖形操作、長時間連線、批次連續執行和成果下載。
七、把網路操作體驗與主機端計算結果分開判定。
八、為每個專案指定回退版本、負責人與停止條件。
經驗：遠端螢幕延遲只能說明互動體驗，不足以解釋 SPM 的計算效能或結果差異。批次是否完成、檔案是否正確生成，應以主機端日誌和輸出資料判斷。
如果實驗室沒有可用的 Mac，先參考 Apple Silicon Mac 遠端科研環境 的連線方式，再決定是否需要建立短期測試環境。對只需要驗證版本、腳本或工具箱的課題，按週或按月取得一台具完整權限的遠端 Mac，通常比為一次遷移測試提前採購實機更容易控制。
技術支援人員不應替所有課題組成員安裝同一個版本。較穩妥的管理方式，是依專案生命週期建立三種環境：
每個專案都應有一份環境紀錄，至少包括 SPM、MATLAB、macOS、Apple Silicon 架構、擴充套件、腳本版本、資料位置與回退方法。若成員只收到一個可登入的遠端帳戶，卻沒有路徑、授權和輸出目錄規則，後續問題仍會集中回到管理者身上。
我們建議把「停止遷移」寫成明確條件：MEX 無法載入、關鍵批次欄位行為改變、統計輸出差異無法解釋、Standalone 缺少必要工具箱，或長時間批次無法穩定完成時，立即回到 SPM12。這比以日期或「新版已發布」作為切換依據更可靠。
以下評分不是對軟體功能的排名，而是以科研交付風險作為尺度；分數越高，代表在該類場景越容易建立可控流程。
| 使用情境 | SPM 25.01.02 | SPM12 | 建議 |
|---|---|---|---|
| 全新神經影像課題 | 5/5 | 3/5 | 預設選 SPM 25.01.02 |
| 在研論文與歷史復現 | 2/5 | 5/5 | 先保留 SPM12 |
| 自訂腳本與擴充維護 | 3/5 | 4/5 | 雙軌回歸 |
| 無 MATLAB 授權的學生 | 需驗證 | 需驗證 | 先評估 Standalone 邊界 |
| Apple Silicon 遷移 | 4/5 | 4/5 | 分離路徑與目錄後比較 |
| 課題組長期管理 | 5/5 | 5/5 | 新舊專案分層管理 |
最終可以用以下條件作決定：沒有歷史結果負擔，就選 SPM 25.01.02；已有論文結果或固定腳本，就保留 SPM12；需要遷移，就雙軌執行，並以代表性資料和預先定義的通過標準收尾。
全新建立的 fMRI、PET、EEG 或 MEG 專案，若沒有必須延續的舊環境，建議以 SPM 25.01.02 建立基線。先完成版本輸出、圖形介面、最小批次和結果檔案驗收，再擴展到完整資料。
SPM12 腳本不能僅因為能在新版介面中開啟，就被視為已完成相容。應檢查函式呼叫、批次欄位、預設參數、MEX 檔案與第三方工具箱，並以相同脫敏資料比較關鍵輸出；無法解釋的差異都應觸發回退。
SPM 25 Standalone 可以作為沒有 MATLAB 授權時的候選路線，但必須確認 Runtime、圖形介面、批次方式和擴充套件需求。若研究流程依賴自訂 MATLAB 程式，請先完成小樣本驗證，不能只按授權成本選擇。
SPM 25 與 SPM12 應使用不同目錄、MATLAB 路徑、啟動檔案、暫存位置和輸出目錄。完成原生架構與 MEX 載入測試後，再執行圖形介面、批次連續處理和成果下載驗收，避免新版本覆蓋舊環境。
在研論文升級版本可能影響結果重現，因此不宜安排在投稿、審稿回覆或主要結果重算期間。請先保留只讀原始資料與 SPM.mat，在副本中完成雙軌比較；只有關鍵結果、檔案結構和處理記錄均符合標準，才考慮切換。
如果目前方案是共用 Linux 或 Windows 主機，常見限制包括沒有原生 macOS 環境、無法方便驗證 Apple Silicon 架構、多人共用 MATLAB 路徑容易互相污染，以及為一次版本回歸而長期維護閒置設備。對正在遷移 SPM 的課題組而言，這些成本往往比單純的硬體價格更難處理。
若實驗室需要的是短期驗證、跨版本回歸或交付前測試，租用 VNCMac 的遠端 Mac 可以提供完整權限與獨立環境，讓團隊同時保留 SPM12 和 SPM 25.01.02，再以同一份脫敏任務做出可追溯的判斷。可先查看 VNCMac 的 Mac 租用選項；若課題需要長期固定負載、直接連接本地儀器或必須完全離線，購買實機仍可能更適合。
如果是全新建立的 fMRI、PET、EEG 或 MEG 分析流程，且沒有必須延續的歷史環境，建議先以 SPM 25.01.02 建立基線。請以官方發行頁、安裝文件、版本輸出、圖形介面啟動、最小批次與結果檔案作為驗收證據，而不是直接複製舊課程的 SPM12 設定。
不能只因為批次介面能開啟，就判定 SPM12 腳本已相容。應逐項檢查函式呼叫、批次欄位、預設參數、MEX 檔案與第三方工具箱，使用脫敏代表資料執行完整流程；任何無法解釋的輸出差異，都應保留 SPM12 並停止直接遷移。
可以先評估 Standalone 路線，但它不等於完整 MATLAB 環境。需要核對 MATLAB Runtime、圖形介面、批次執行方式，以及研究流程所依賴的自訂 MATLAB 程式與額外工具箱是否可用。若流程依賴自訂程式碼，應先用小型代表資料驗證，不能只按授權成本做決定。
兩個版本應放在彼此隔離的目錄，分別使用獨立的 MATLAB 路徑、啟動檔案、暫存位置與可寫資料夾。先確認原生架構與 MEX 載入，再分別測試圖形介面、批次連續執行及成果下載。不要讓新版本覆蓋舊版資料夾，也不要共用未經檢查的 startup 設定。
有可能，因此投稿、審稿或正在整理結果的專案不應把升級安排在關鍵節點。請保存原始 SPM.mat、批次腳本、預設設定、輸入資料與環境資訊，再於副本中執行新版回歸。只有在預先定義的關鍵輸出、統計圖與檔案結構均通過比較後，才適合考慮遷移。